S231でアヌビスが父親は自分だと主張するセトに「全ての神々がそうであるように誰が私の根源にあるのかは本能で分かります」って言っているからセトも自分の母親がヌトなのは本能でわかっているんじゃないかな?
養子説は無いと思う