Unity上でFBXファイルをクリックしてインスペクターのModelタブ
Convert Unitsのチェックが入ってるなら外す、入ってないなら入れてみて

それとUnity上でボーン植え込んで着せ替えるなら、Blenderで本体のボーンに移植しなくていい
服のボーンはそのままでメッシュ変形させてやればいい