・CD版発売時に店頭特典用に書き下ろされた以下2シナリオを本編中（卒業直前）に挿入
「宿り樹の腕輪（紫苑さんルート）」 「翼を継ぐ者たち（貴子さんルート）」
・瑞穂フルボイス化（モノローグ部分除く） サブキャラフルボイス化（APPENDIXのナンパ男を除く）
・CD版の初回特典「ツンデレラ」をマニュアル内に収録
・大人の事情により学校名を「恵泉→聖應」に変更
・実売価格が1000円ほど安価に
・おまけシナリオにボイスが付いた
・１話の予告が微妙に変更
※ゲーム中BGMが変更されるとノイズが入る場合は公式サイトから修正パッチをダウンロードして適用して下さい。
※CD版同様ディスクレスプレイ可
□おまけシナリオ（APPENDIX）
Episode .│サブタイトル │ＣＤ版│DVD版│やるきばこ│PS2 .|やるきばこ２
Episode I │夕陽（ひ）のあたる教室（へや）......│ . ○ │. ○ │ .│ (V) │
Episode II ..│操りの弦（いと） 双（ふた）りの音..│ . ○ │. ○ │ .│ .│
Episode III . │Secret of my heart │ . ○ │. ○ │ .│（VI）│
Episode IV │まりやとかが見てる │ . ○ │. ○ │ .│ .│
Episode V.....│宿り樹の腕輪（ミストルテイン） │○＊1│.○＊3.│ ○ .│（IV）│
Episode VI │宮小路家のお正月. │. │. │ ○ .│（ I ）│
Episode ＶＩＩ..│おみやげに於ける諸問題.. │○＊2│. │ ○ .│（III.） |
│ （スーヴェニア・プロブレム） . │. │. │ .│ .│
Episode VIII.│翼を継ぐ者たち │. │.○＊3.│ ○ .│（.II.）│
Special │卒業旅行に行きましょう. │. │. │ ○ .│ .│
Episode X |そして、そこに立つ者たちの肖像 .| . |. | . | . ｜ ○
│ （ポートレイト）│. │. │ .│ .│
Episode XI │恋と愛の主題による変奏曲 │. │. │ .│ .│ ○
│ （ヴァリエーション）.│. │. │ .│ .│
＊1：CD版初回購入店舗特典ディスクに収録（ボイス無し）
＊2：TECH GIAN 2005年2月号・3月号の付録ディスクに前後編に分けて収録（ボイス無し）
＊3：DVD版では本編シナリオ内(卒業式前)に挿入(ボイス有)