今所持してるアイテムの総数はどれくらい？
以前は1000までだったのが影響してるのかもしれんので、
要らんアイテムを沢山捨てた後に再発するかどうか確認してみてはどう？

まあ何が原因か分からんから、先に破片全部回収してから宝箱やら赤玉に触れた方が無難かな、クリアするなら