実は人類は絶滅しており、主人公や女学生たちは残された最後の生き残り
研修旅行というのは刷り込まれた擬似記憶で、過去の生活環境を再現した人類再生計画の一環
伯母の正体はマザーコンピュータ

という裏設定が……