Modに関しては検索して勉強してもらうしかないんだけど
2.0でも2.5でもModは使える。これは基本
2.5では未対応のModがあるのでそれを使いたいと思う可能性があるなら2.0がお勧め
主要なものとしては、以下の3つのプラグイン型Modは2.5対応版がリリースされていない
衣装の色変えなどが行える ACCex
メイドさんの撮影をすると時に超便利な 複数メイド撮影プラグイン
ムラムラっと来た時にメイドさんを押し倒せる VibeYourMaid
これらを使いたいなら2.0
衣装系のModは全て2.5でも使える
まるさんの衣装、ばつさんのフェイス、さんかくさんの髪とか
2.5で全然大丈夫
あと、2.5とKECS（CREdit）は別のプログラムなので注意
KCESと連携してハイポリキャラをKCESからインポートしてこれるのが2.5
2.5自体は2.0とできることはほぼ同じ
KCフェイス（2.5専用の鼻周りの調整項目が増えたFbフェイス）加わったぐらいの感じ
基本機能はわずかだが2.5の方が上なので
Modの問題がクリアできるなら2.5をお勧めしたい
補足になるが
2.0で作成したキャラデータは2.5で読み込めるけど
2.5で作詞したデータは2.0には持っていけない