非嫡出子でもちゃんと父親が認知しているなら
父の欄にはその父親が、母の欄には母親である姉がそれぞれ記載されるだろ

戸籍は戸主からの続柄しか記載されないから、父親が戸主ならそれぞれ長女と次女で
次女の母の欄に長女の名前が載るだけ