ここでは、フラワーナイトが殲滅に失敗したために大量発生した害虫が急速に勢力を拡大。
その勢いはとどまる気配を見せず、スプリングガーデンは実質上、
機能停止状態に追い込まれています。
前作のストーリーからわずか1カ月、
至る所にはびこる害虫によって、人類文明は大混乱に。
通信機能は停止し、政府は崩壊、軍隊は壊滅状態です。
スプリングガーデンの民衆は、生き残りと自己防衛の術を身に着け、
運よく生き残った人々は身を隠してしまいました。
しかし、中には希望を捨てない者も…
市民団体と傭兵が力を合わせて、大量発生に立ち向かう組織を結成し、
さらに私財を投じてスプリングガーデン各地に作戦基地を設けたのです。
プレイヤーは、拡大を続ける害虫を追ううちに敵の拠点を発見し、
せん滅を試みることになります。