＞これにより『ボス毎に編成を変えるのが面倒』というご意見にも対応できるものと考えています。

この意味が最初分からなかったが、999回と自動周回にしたことを踏まえての発言という事は
「1ボスにつき3回　”しか”　戦えないからいちいち違う編成にしなきゃならないのが面倒」
ってのがユーザーの不満の根本だと勘違いしてるのかそういう事にしたいだけなのか