特殊なことでもないから簡単に説明するけど
json→atlasの紐づけは「jsonと同名のファイル」、.atlas→.pngの紐づけは「atlasの中身」で実行されてる
よくわからんかったら3つともatlasの中身のファイル名にリネームしてjson読み込めばおk