そりゃ本編開始時点のクラウド君はソルジャーだった記憶とソルジャーの戦闘服と共に肉体は1stクラスのソルジャーになってるからね
セフィロスを突き落とした後ザックスと一緒に宝条の私兵に回収されて改造手術をされてる
クラウドは重度の魔洸中毒で意識混濁+記憶混同
ザックスはソルジャーの肉体に更に改造された影響で寿命をちぢめてる