ざっくり時系列を整理

最初の隕石災害(プリマンやオデア等が被災)　星源汚染が始まる　主人公たちが能力に目覚める
主人公、大学生になる(同級生ダリアン、幼いハーティと出会う)
4年経過して大学を卒業して傭兵に(タイトル画面の4人やルビー、ローサラと出会う。ダリアンの記憶を失い別れる)　この時点で少なく見積もっても22歳以上
いくらかの年月が過ぎて第二次隕石災害発生(使徒降臨)
どうにか勝ったものの主人公は意識不明で寝込む(ここまでが序章)
ラファレ、ルシマ、エルレウスが方舟総裁になる　黒幕達が暗躍しだす　クローン達が作られ始めたのはおそらくこのタイミング
10年経過して主人公が目覚める　成長したルビーと再会　リハビリの後に傭兵団の団長に戻る　この時点で主人公は30代前半〜半ばくらい
ルビー、イガーリ、マーシャ、トリストと行脚開始(ここが第1部)
2部開始時点で1年くらい経ってる？

で合ってるはず
ハーティは(あの見た目で)ルビーやミカイロと同年代かちょい上くらい
ミラベル母娘は年代設定と微妙に齟齬があるが、ミラベルが主人公より年上なのは確実
クローン達は年長らしきヘスティアでも10歳いってないと思われる
パニクス、パンタシア等の異星人は特定できる情報がないので謎