SNの後にZEROができたんで設定がちょっと辻褄合わなくなってるんだけど
SNの時には桜は刻印虫で内臓ボロボロなので既に孕めぬ状態というのが前提にあって
ZEROの時点である程度はジジイが説明してたけど
ジジイは優秀な魔術師を産む確率の高い母体を持った家系（桜の母親の葵）の女が欲しかった
葵と雁夜をくっつけようと思ったけどできなかった（葵と時臣は両思いで雁夜がBSS拗らせて出奔）
お家断絶に悩んでたジジイの所に時臣から養子の申し入れがあったんで
桜もらって優秀な魔術師の男を婿に迎えよう計画に変更
虫姦は桜がもともと持ってた属性を間桐の属性に変更するためにやってた。この時点ではまだ子供を孕める状態
ZEROの聖杯戦争が失敗に終わった事を知ったジジイが次の聖杯戦争が60年経たずに起きるのを推測して
桜の子供や孫を待ってる時間がないと推測して桜に直に魔術刻印（刻印虫）を刻む方向転換をした
という辻褄合わせになってる
内臓ボロボロでも桜が生きてるのは刻印虫がいる限り桜は生命維持されるんで問題ない
あとエロゲ版の虫はこちらでございます
https://pbs.twimg.com/media/Dw8fzUIUYAEjfla?format=jpg&name=small