Desktop modeでしか試していませんが、以下の手順でmorphのatomを動かすことはできませんた。 確認バージョンはVAM1.20.1.5です。
実際には省ける手順があるかもしれません。
1) Scene Animationタブを開く
2) Begin Record Modeボタンを押す
3) Select Controllers Enabled For Recordボタンを押す
4) 動かしたいmorphのatomをクリック
5) Begin Record Modeボタンを押す
6) 動かしたいmorphのatomの上にマウスカーソルを移動させてからキーボードのスペースを押して記録開始
7) morphのatomをマウスで移動させる
8) もう一度スペースを押して記録終了