それでいいはず
>>509が貼ってくれてるようにMEのalpha項目名右横にある〇ボタンを押すと、TimeLineのMaterialEditor項目の中にFloat Propertyが追加される
その行で１回キーを打てば他項目と同じく上部に項目が追加されて編集できるようになる
MEに〇ボタンが出てこなかったり押してもTimelineに追加されないならまずはバージョンアップをお試しあれ
ttps://gitgoon.dev/IllusionMods/HSPlugins/releases/
alpha項目のあるシェーダーでもモノによっては透明度が段階的にしか変わらないことがある。Shader Foreg/main_item_sudio_alphaとかがそう
MEの画面でalphaのスライダーをゆっくり変更してちゃんと細かい数字が反映されるシェーダーを選んだほうがいい
あとは指定値以下で描画しなくなるCutout項目も0にしとかないと、いきなり消えることになる