DeskTopとVRで顔の見え方が異なるのは、FOV（Field of View、視野角）が異なるから

DeskTopでは初期設定のFOV値が40（ディスプレイが広いので画面の端の歪みの抑えを優先）
VR機器の平均的なFOV値が100前後（ディスプレイが狭いので奥行き感を優先できる）

実際にDeskTopモードでFOVを上げればVRと同じ感じ奥行き感(立体視的という意味ではなく)になる